As eliminações do SC Braga (perdeu diante do Shakhtar Donetsk) e Sporting (perdeu em Varsóvia e ficou em último lugar do grupo na Champions) fizeram com que a Liga Europa ficassem órfãos de clubes portugueses para os 16 avos der final.

Para encontrarmos a última época sem emblemas lusos na fase a eliminar na segunda prova de clubes da UEFA é preciso recuar até à época de 2005/06. Na altura, o Vitória de Guimarães era a única equipa portuguesa em competição, tendo ficado em último lugar num grupo que tinha como adversários o Besiktas, Bolton, Sevilha e Zenit.

Ainda nessa dessa temporada, mas na Liga dos Campeões, o FC Porto também ficou em último lugar no grupo e o Benfica chegou aos quartos de final, mas foi eliminado pelo Barcelona.