O sorteio da fase de grupos da Liga Europa, a decorrer no Mónaco, colocou já o Sporting no grupo G, ao lado de Basileia, Genk e Videoton.

A Académica fica no grupo B, juntamente com At. Madrid, Hapoel Telavive e Viktoria Plzen.

Já o Marítimo foi o clube português com menos sorte neste sorteio, ao cruzar-se com Newcastle, Bordéus e Club Brugge.

A fase de grupos disputa-se de 20 de setembro a 06 de dezembro, com os dois primeiros de cada um dos 12 grupos a seguirem para os 16 avos de final - a 14 e 21 de fevereiro de 2013 -, juntamente com os oito terceiros da Liga dos Campeões. 

Grupo A

Liverpool, Udinese, Young Boys, Anzhi 

Grupo B

At. Madrid, Hapoel Telavive, Viktoria Plzen, Académica

Grupo C

Marselha, Fenerbahçe, Borussia Moenchengladbach, AEL Limassol

Grupo D

Bordéus, Club Brugge, Newcastle, Marítimo

Grupo E

Estugarda, Copenhaga, Steaua Bucareste, Molde

Grupo F

PSV, Nápoles, Dnipro, AIK Estocolmo

Grupo G

Sporting, Basileia, Genk, Videoton

Grupo H

Inter, Rubin Kazan, Partizan, Neftçi

Grupo I

Lyon, Athletic Bilbao, Sparta Praga, Kyriat Shmona,

Grupo J

Tottenham, Panathinaikos, Lazio, Maribor

Grupo K

Bayer Leverkusen, Metalist, Rosenborg, Rapid Viena

Grupo L

Twente, Hannover, Levante, Helsingborg